ОАО «Агроплемсоюз» по праву отсчитывает свою историю с приказа Минсельхоза СССР об образовании Управления государственных племенных заводов. Именно эта структура Управления животноводства, объединив вокруг себя специализированные племенные хозяйства страны, определила цели и задачи, направления и приемы организационной и управленческой деятельности в отечественном животноводстве, которые в современных условях уже не одно десятилетие реализует акционерное общество «Агроплемсоюз».

Октябрь 1964 года ликвидировал совнархозы, которые из-за территориального принципа управления нарушали сложившиеся многими десятилетиями производственные связи. Тем самым был обеспечен возврат к централизованному отраслевому управлению сельским хозяйством и промышленностью.

В 1965 г. решением Президиума Верховного Совета СССР в Минсельхозе СССР было создано Главное управление животноводства, перед которым была поставлена непростая задача разработки концепции экономического развития отечественных племенных хозяйств, а также определения направлений племенной работы в стране.

Для практического выполнения этой задачи Главному Управлению животноводства Министерства сельского хозяйства СССР было передано 70 госплемзаводов, 11 опытных молочно-мясных и свиноводческих совхозов, а также 4 научно-исследовательских института с прикрепленными к ним 10-ю экспериментальными хозяйствами.

Значительная часть подчиненных Управлению животноводства научных учреждений и племпредприятий являлись специализированными, в том числе:

29 — занимались разведением крупного рогатого скота,
20 — свиноводством,
21 —овцеводством.

Хозяйства располагались как на территории Российской Федерации, так и на землях Украинской, Белорусской, Молдавской, Литовской, Казахской, Узбекской и Туркменской союзных республик.

На руководящие должности новой структуры были приглашены высококвалифицированные специалисты, обладавшие большим объемом профессиональных знаний и опытом как производственной, так и управленческой деятельности.

Руководство Главным управлением животноводства Минсельхоза СССР численностью 150 человек, было поручено высоко эрудированному специалисту, профессионалу-Михаилу Николаевичу Луценко - автору новой скороспелой мясной породы свиней. Знание отечественного животноводства позволяло ему с успехом отстаивать принципиальные позиции развития отрасли, в особенности племенной его части.

Для непосредственного руководства племенным делом страны в сентябре 1965 г. в составе Главного управления было образовано Управление государственных племенных заводов. Первый его руководитель (1965-1973)- Александр Иванович Кравченко— один из крупных организаторов, внесший значительный вклад в становление современного отечественного племенного дела.

Благодаря действенному контролю вновь созданного Управления, целевые капиталовложения, фонды кормов, а также высокопродуктивное импортное поголовье, которое распределялось тогда в соответствии с принципами плановой экономики, стали доходить непосредственно до хозяйств.

Результаты не замедлили сказаться на показателях племенного животноводства в подчиненных управлению хозяйствах. Кроме того к разработке планов подъема хозяйств были привлечены ведущие ученые и специалисты. Начался заметный подъем экономики, возросла численность поголовья, увеличилось количество и повысилось качество племенного молодняка.

Спокойный и устойчивый ритм работе Управления госплемзаводов придало назначение Петра Ивановича Корнеева на должность начальника Главного управления животноводства МСХ СССР. Крупный специалист и хозяйственник, прошедший все ступени работы зоотехника, он сменил на этом посту М.Н. Луценко.

Заметный вклад в развитие племенной базы животноводства СССР в 1976—1987 гг. внес заместитель министра сельского хозяйства СССР Лев Николаевич Кузнецов. Именно в этот период было много сделано для создания материально-технической базы племзаводов, подчиненных Главному управлению животноводства Минсельхоза СССР. Хочется отметить большую заботу этого выдающегося российского зоотехника о племенных заводах страны. При его поддержке и участии разрабатывались комплексные планы по животноводству и племенному делу, а также принимались программы для конкретных хозяйств и регионов.

С 1973 г. руководство Управлением племзаводов, после ухода на заслуженный отдых А.И.Кравченко, легло на плечи Алексея Георгиевича Данкверта, приглашенного на эту должность с поста директора племзавода «Большевик» Тульской области При этом одновременно А. Г. Данкверт был назначен заместителем начальника Главного управления животноводства.

С участием специалистов управления был подготовлен и принят на правительственном уровне ряд важных и принципиальных решений по укреплению материально-технической базы племенного животноводства, улучшению пород скота, расширению племенных хозяйств и ферм и многому другому. Благодаря усилиям и опыту специалистов управления обеспечивалось совершенствование отечественного племенного дела в современных условиях. 

О результатах деятельности Управления государственных племенных заводов можно судить уже по тому факту что в 1970-1980-е годы племенная база страны в достаточной мере удовлетворяла потребности отечественных товарных хозяйств. Однако наступило то время, когда экономическое положение в стране в целом и в сельском хозяйстве в частности начало заметно ухудшаться, требовались новые формы работы.

В результате очередной реорганизации министерств союзного подчинения в октябре 1989 года на базе реально работающего Управления племенных заводов было создано Всесоюзное агропромышленное объединение племенных заводов и заготовки племенного скота «Союзплемзавод» при Госагропроме СССР. На вновь созданное объединение были возложены практически те же, что и на ранее существовавшее управление, весьма ответственные задачи.

Кардинально меняющаяся ситуация в стране открывала новые экономические возможности и перспективы. В лучших племхозах СССР был достигнут уровень продуктивности скота развитых стран, создан огромный генофонд породного скота. Однако нужно признать, что в целом по отрасли сохранялось еще значительное отставание.

Распад СССР грозил полным упадком численности племенного скота, оставшегося без государственной поддержки. В этих условиях на «Объединение племенных заводов» возлагалась важнейшая задача по спасению инфраструктуры и племенного поголовья в условиях неорганизованного рынка. Благодаря своевременно и правильно принятым мерам, племенное животноводство не понесло в 90-е годы таких значительных потерь, какие наблюдались в товарном производстве.

В 1990 г. на базе ВАПО «Союзплемзавод» в целях совершенствования экономического механизма и повышения эффективности хозяйствования было создано экономически самостоятельное открытое акционерное общество «АГРОПЛЕМСОЮЗ».